Das Paul-Klee-Gymnasium besteht seit dem Schuljahr 2000/2001, es wurde bis zum 21. Juli 2010 unter dem Namen Zweites Städtisches Gymnasium (ZSG) geführt. Hier lernen und arbeiten gegenwärtig 555 Schülerinnen und Schüler sowie 54 Lehrerinnen und Lehrer (zzgl. 14 Referendare). Als das Eugen-Bolz-Gymnasium  für die vielen Rottenburger Schüler zu klein geworden war, kam der Anstoß für den Bau unseres Gebäudes. Noch immer besteht eine Kooperation der beiden Gymnasien, so dass gelegentlich einzelne Lehrer an beiden Schulen unterrichten. Außerdem kooperieren wir in den Fremdsprachen und in der Oberstufe mit dem Sankt-Meinrad-Gymnasium.